Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms