Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms