Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc8D3YZV8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms