Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3259D3YUK0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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