Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm17333C6EQI3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm17333C6EQI3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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