Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6133B2RY53 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6133B2RY53 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms