Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms