Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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