Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms