Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms