Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm2012B1B0R1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm2012B1B0R1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms