Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a6B1AVK5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a6B1AVK5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms