Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NhsB1AV60 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms