Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spocd1B1ASB6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spocd1B1ASB6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms