Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn8B1ARD8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms