Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm6880A3KG45 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm6880A3KG45 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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