Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Atp8b5A3FIN4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp8b5A3FIN4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atp8b5A3FIN4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms