Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms