Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms