Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34dA2AGU5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34dA2AGU5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms