Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms