Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pramef6A2A8M8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef6A2A8M8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms