Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27029A2A4P4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms