Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms