Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms