Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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