Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms