Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Top3bQ9Z321 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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