Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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