Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcniQ9Z2V9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms