Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn6Q9Z262 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn6Q9Z262 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn6Q9Z262 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn6Q9Z262 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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