Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms