Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp2Q9Z0E6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp2Q9Z0E6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms