Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin2Q9WVE8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms