Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms