Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx1Q9WV80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx1Q9WV80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms