Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cited4Q9WUL8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited4Q9WUL8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms