Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scnn1bQ9WU38 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms