Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SnurfQ9WU12 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms