Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nfe2l3Q9WTM4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms