Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hic1Q9R1Y5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms