Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms