Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp11cQ9QZW0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms