Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh2d3cQ9QZS8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms