Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col4a4Q9QZR9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms