Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Npas3Q9QZQ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms