Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gpc1Q9QZF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gpc1Q9QZF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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