Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ercc4Q9QZD4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms