Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Six6Q9QZ28 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms