Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms